現在、一部のコーヒー産国では基本的に特定のコーヒー品種しか生産していないケースがある。たとえばブラジルは主にボルボン種を、ジャマイカのブルーマウンテンは主にティピカ種などを生産している。

実は、多くの場合、コーヒー品種が伝播して現地に広まり、現地の環境によく適応した結果、その土地の主要生産品種の一つになったという背景がある。また、国のコーヒー研究所が研究開発した新品種が、その国で大々的に普及・栽培されているケースもある。

一部の国がコーヒー品種の研究を行っているのは、19世紀に重大なさび病の災害が発生したため、より耐病性の高いコーヒー品種を研究する必要があったからである。また、高収量で耐病性があり、かつ良好なフレーバーを併せ持つ新世代のコーヒー品種の開発も望まれている。

歴史の記録によれば、19世紀末に史上最大規模のさび病災害が発生し、東半球（アジア、アフリカの大部分）のほぼすべてのコーヒーの木が壊滅した。その後、アラビカコーヒー品種を西半球（アメリカ地域）へ移して栽培する動きが始まった。

このさび病災害により、一部のコーヒー産国はより強健な品種であるロブスタの栽培へ転換し、また一部の国は国立コーヒー研究所を設立し、耐病性を持つコーヒー品種の研究を進めるようになった。しかし、資金を投じて研究開発された品種は、その特性から政府が必然的に全国的な栽培を推進するため、これらの国々は自国で開発した新品種を主に生産するようになった。

現在、比較的よく見られる研究室由来の品種には、ケニアのSL28、SL34、Ruiru 11、ラテンアメリカでよく見られるF1交配種のH1、そして今や世界で一般的なカトゥアイ（Catuai）などがある。

カトゥアイ Catuai

カトゥアイCatuaiは、高生産性のムンドノーボMundo NovoとカトゥーラCaturraの交配品種である。ブラジル・カンピーナスのサンパウロ州農芸院（IAC）によって作出された品種である。カトゥアイは生産性が高く、樹体が小さいなどの特徴を持つため、密植が可能であり、その特性から現在アメリカ大陸の多くの国々で栽培されている。

SL28、SL34、Ruiur11

この2つの品種は、ケニア政府が20世紀の1930年代末に、旧スコット農業試験場Scott Laboratories（現在の国立農業試験場）に委託し、42品種を選んでその収量、品質、耐旱性・耐病性を研究させ、スコット試験場の略称SL＋数字で42品種を命名したものである。最終的に、このSL28とSL34は品質・フレーバーともに良好で収量も高いが、コーヒー病害にかかりやすいことが分かった。

Ruiru 11はカティムを母本とし、父本は複雑な交配体である。1968年、ケニア国内でコーヒーさくらんぼ病（CBD）が発生し、コーヒー生豆が約50%減産したことから、Ruiruにあるコーヒー研究所が育種計画を開始し、CBDに免疫を持つ品種を育成した。育種の専門家は多年をかけてまずRuiru 11の父本を開発し、K7、SL28、N39、Rume Sudanなど複数の品種の優れた特性を兼ね備えた。1985年、現地名にちなんでRuiri 11が発表された。この品種は収量が多く品質も良く、さくらんぼ病への耐病性を持ち、さび病にも一定の耐病性を持つが、線虫類の害を受けやすい。

そのため、現在ケニアのコーヒー豆を購入すると、SL28、SL34、Ruiru 11のいずれかであることが多い。たとえば前街珈琲（FrontStreet Coffee）のケニア・アサリアコーヒー豆は、SL28とSL34品種を使用している。

H1

H1品種はF1コーヒー品種育種計画から選び出されたもので、ますます猖獗を極めるコーヒー病害に対抗できる品種を求めて、フランス農業研究開発センター（CIRAD）と中米諸国コーヒー機関（ROMECAFE）が共同で打ち出した新品種育成計画によるものである。

さらに美洲農業研究所（IIAC）とコスタリカ熱帯植物研究センター（CATIE）が実施を支援した。CATIEは数百のコーヒー品種から、カトゥーラ、カトゥアイ、カティム、サルチモ（ビジャサルチとティモの交雑種）、および古いアフリカ野生品種Rume Sudanを選び、人工受粉の手法でT5296（サルチモの後代）の花粉を採取し、Rume Sudanの花蕊に塗布した。

5年の努力を経て、CATIEは計100の異なる新世代を収穫し、そのうち成績の優れた20系統を選んで繁殖・育成した。これらのF1初生世代は、より強い耐病性と耐旱性を備えるだけでなく、より高収量でフレーバーにも優れるという利点を持つ。

そしてH1品種は第一世代F1交配品種群の品種であり、F1第一世代交配系列のT-5296（サルチモ）とSudan Rume（ルメスーダン）を交配して育成された。このコーヒーは品質が良くフレーバーにも優れ、収量は他の伝統的なアメリカ大陸の品種より22%多く、さび病に対して強い抵抗力を持つが、線虫類の害を受けやすい。現在コスタリカではH1品種がよく見られ、前街珈琲（FrontStreet Coffee）のコスタリカ・モーツァルトコーヒー豆はH1品種を採用している。